Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Def8Q99J78 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Def8Q99J78 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Def8Q99J78 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Def8Q99J78 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms