Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Afg3l1Q920A7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Afg3l1Q920A7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Afg3l1Q920A7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms