Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp9Q91WM3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrp9Q91WM3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrp9Q91WM3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp9Q91WM3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp9Q91WM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms