Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHZ7

Imp4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Imp4Q8VHZ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Imp4Q8VHZ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Imp4Q8VHZ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Imp4Q8VHZ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Imp4Q8VHZ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms