Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mark1Q8VHJ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mark1Q8VHJ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mark1Q8VHJ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms