Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc65Q8VHI7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc65Q8VHI7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc65Q8VHI7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms