Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8VDP2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8VDP2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8VDP2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8VDP2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8VDP2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8VDP2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8VDP2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8VDP2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8VDP2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8VDP2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8VDP2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8VDP2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8VDP2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8VDP2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q8VDP2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8VDP2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8VDP2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8VDP2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8VDP2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8VDP2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8VDP2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8VDP2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8VDP2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q8VDP2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8VDP2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q8VDP2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8VDP2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8VDP2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8VDP2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8VDP2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8VDP2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8VDP2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
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