Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam20bQ8VCS3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam20bQ8VCS3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam20bQ8VCS3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20bQ8VCS3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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