Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slf1Q8R3P9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slf1Q8R3P9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slf1Q8R3P9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slf1Q8R3P9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms