Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b4Q8QZY9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3b4Q8QZY9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b4Q8QZY9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms