Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pitrm1Q8K411 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pitrm1Q8K411 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pitrm1Q8K411 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pitrm1Q8K411 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pitrm1Q8K411 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pitrm1Q8K411 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pitrm1Q8K411 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pitrm1Q8K411 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pitrm1Q8K411 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pitrm1Q8K411 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pitrm1Q8K411 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pitrm1Q8K411 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms