Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brd3Q8K2F0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brd3Q8K2F0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brd3Q8K2F0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brd3Q8K2F0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Brd3Q8K2F0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms