Protein–RNA interactions for Protein: Q8K205

Pop1, Processing of 1, ribonuclease P/MRP family, (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop1Q8K205 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pop1Q8K205 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pop1Q8K205 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pop1Q8K205 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pop1Q8K205 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms