Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkd3Q8K1Y2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prkd3Q8K1Y2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkd3Q8K1Y2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkd3Q8K1Y2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkd3Q8K1Y2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prkd3Q8K1Y2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prkd3Q8K1Y2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms