Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34c1Q8K193 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Cldn34c1Q8K193 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn34c1Q8K193 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn34c1Q8K193 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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