Protein–RNA interactions for Protein: Q8K094

Pvr, Poliovirus receptor, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvrQ8K094 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PvrQ8K094 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PvrQ8K094 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PvrQ8K094 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PvrQ8K094 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PvrQ8K094 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PvrQ8K094 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms