Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Podxl2Q8CAE9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Podxl2Q8CAE9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podxl2Q8CAE9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podxl2Q8CAE9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Podxl2Q8CAE9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms