Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Strip2Q8C9H6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip2Q8C9H6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strip2Q8C9H6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strip2Q8C9H6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.1 ms