Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Alx1Q8C8B0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Alx1Q8C8B0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Alx1Q8C8B0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alx1Q8C8B0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms