Protein–RNA interactions for Protein: Q8C878

Uba3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba3Q8C878 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba3Q8C878 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba3Q8C878 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba3Q8C878 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba3Q8C878 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba3Q8C878 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba3Q8C878 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uba3Q8C878 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms