Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin9Q8C735 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin9Q8C735 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lin9Q8C735 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lin9Q8C735 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms