Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930504O13RikQ8C5Z9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930504O13RikQ8C5Z9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930504O13RikQ8C5Z9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms