Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccz1Q8C1Y8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccz1Q8C1Y8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccz1Q8C1Y8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccz1Q8C1Y8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccz1Q8C1Y8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccz1Q8C1Y8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms