Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc30Q8BVF4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc30Q8BVF4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc30Q8BVF4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc30Q8BVF4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms