Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod1Q8BVA4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod1Q8BVA4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lmod1Q8BVA4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms