Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp398Q8BV16 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp398Q8BV16 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp398Q8BV16 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp398Q8BV16 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms