Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl38Q8BSF5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhl38Q8BSF5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhl38Q8BSF5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms