Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zcchc4Q8BKW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc4Q8BKW4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc4Q8BKW4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms