Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tnrc6bQ8BKI2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tnrc6bQ8BKI2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnrc6bQ8BKI2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnrc6bQ8BKI2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnrc6bQ8BKI2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms