Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJA2

Slc41a1, Solute carrier family 41 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc41a1Q8BJA2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc41a1Q8BJA2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc41a1Q8BJA2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc41a1Q8BJA2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms