Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ37

Tdp1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdp1Q8BJ37 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdp1Q8BJ37 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tdp1Q8BJ37 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tdp1Q8BJ37 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdp1Q8BJ37 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tdp1Q8BJ37 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdp1Q8BJ37 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdp1Q8BJ37 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdp1Q8BJ37 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdp1Q8BJ37 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdp1Q8BJ37 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdp1Q8BJ37 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdp1Q8BJ37 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdp1Q8BJ37 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms