Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy1Q8BIJ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy1Q8BIJ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms