Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Necab1Q8BG18 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Necab1Q8BG18 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Necab1Q8BG18 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms