Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.6Q85ZW5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M10.6Q85ZW5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-M10.6Q85ZW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms