Protein–RNA interactions for Protein: Q810P2

Odf3l1, Outer dense fiber protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3l1Q810P2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf3l1Q810P2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf3l1Q810P2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf3l1Q810P2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms