Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx32Q80ZJ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx32Q80ZJ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx32Q80ZJ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx32Q80ZJ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx32Q80ZJ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx32Q80ZJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx32Q80ZJ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx32Q80ZJ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx32Q80ZJ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx32Q80ZJ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms