Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp8Q80U87 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp8Q80U87 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp8Q80U87 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp8Q80U87 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp8Q80U87 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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