Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms