Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atf7ipQ7TT18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Atf7ipQ7TT18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Atf7ipQ7TT18 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atf7ipQ7TT18 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms