Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IfnkQ7TSL0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IfnkQ7TSL0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IfnkQ7TSL0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IfnkQ7TSL0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IfnkQ7TSL0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IfnkQ7TSL0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms