Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp397Q7TNK4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp397Q7TNK4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp397Q7TNK4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp397Q7TNK4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp397Q7TNK4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms