Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sbno2Q7TNB8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno2Q7TNB8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sbno2Q7TNB8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sbno2Q7TNB8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms