Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed3Q78IS1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed3Q78IS1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed3Q78IS1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms