Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mindy1Q76LS9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mindy1Q76LS9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mindy1Q76LS9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms