Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rph3alQ768S4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rph3alQ768S4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rph3alQ768S4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rph3alQ768S4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rph3alQ768S4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Rph3alQ768S4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rph3alQ768S4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rph3alQ768S4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rph3alQ768S4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rph3alQ768S4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rph3alQ768S4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rph3alQ768S4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rph3alQ768S4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms