Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms