Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc9c1Q6UJY2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc9c1Q6UJY2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc9c1Q6UJY2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms