Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casc1Q6TDU8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casc1Q6TDU8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casc1Q6TDU8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casc1Q6TDU8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms