Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudcd1Q6PIP5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudcd1Q6PIP5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nudcd1Q6PIP5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nudcd1Q6PIP5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nudcd1Q6PIP5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms