Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc4Q6PHQ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pabpc4Q6PHQ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pabpc4Q6PHQ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc4Q6PHQ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pabpc4Q6PHQ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc4Q6PHQ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms